ETUDE DU MICROBIOME
ANALYSE DES COMMUNAUTÉS MICROBIENNES
- Analyse de sols, boues, eaux.....tous types de matrices environnementales
CARACTÉRISATION ET SUIVI DES BACTÉRIES, ARCHÉBACTÉRIES, CYANOBACTERIES, CHAMPIGNONS, CHAMPIGNONS MYCORHIZIENS, LEVURES, MOISISSURES
- Production d’un indice de biodiversité
- Veille écologique
- Etat sanitaire
MESURE DE LA BIOMASSE BACTERIENNE ET FONGIQUE
- Etude la variation de la biomasse bactéries et champignons entre échantillon
- Ratio cibles bactériennes/fongiques
LES POINTS FORTS D’ADNid
ADNid est le spécialiste de l’extraction d’ADN traces : ADN rares et dégradés
A partir de matrices complexes comme : sols, eaux, algues, boues, fèces, produits finis…solides ou liquides riches en polyphénols, polysaccharides, latex, acide humique.. - Spécialiste de l’extraction des ADN traces et endommagés - Utilisation de protocoles « maison » pour optimiser la récupération des populations d’ADN mineurs
Des cibles diversifiées, sur mesure
- Cibles bactériennes : ADNr 16S
- Cibles fongiques : ADNr 18S, ITS1 et/ou ITS2 - cibles mycorhiziennes et autres régions conservées
- Développement de cibles sur mesure
Traitement bioinformatique des données
- Livraison d’un table d’OTU (operational taxonomic unit)
- Calcul de la diversité alpha et beta
- Courbes de raréfaction
- Expression graphique des résultats
- DES RÉSULTATS ACCOMPAGNÉS POUR VOUS FACILITER LA PRISE EN MAIN DES DONNÉES
ADN ENVIRONNEMENTAL
ADN environnemental (ADNe) est une technique de pointe, de plus en plus utilisée au cours de ces dernières années. Elle consiste principalement en l’identification d’espèces à partir de l'ADN qu'elles laissent dans leur environnement. Cette méthode s’appuie sur des techniques de biologie moléculaire (PCR, séquençage…). Bien qu’il existe de nombreuses limites, l’ADNe est utilisé dans des domaines variés allant de la génomique à l’écologie, en passant par la paléobiologie et l’évolution.
- Analyses de régimes alimentaires
- Estimation de la biodiversité d'un ecosystéme
- Détection d'espèces
- Estimation d'abondances
Un outil pour espionner les espèces sauvages
