AGROECOLOGIE ET ENVIRONNEMENT

ETUDE DU MICROBIOME

ANALYSE DES COMMUNAUTÉS MICROBIENNES 

  • Analyse de sols, boues, eaux.....tous types de matrices environnementales

CARACTÉRISATION ET SUIVI DES BACTÉRIES, ARCHÉBACTÉRIES, CYANOBACTERIES, CHAMPIGNONS, CHAMPIGNONS MYCORHIZIENS, LEVURES, MOISISSURES

  • Production d’un indice de biodiversité
  • Veille écologique
  • Etat sanitaire

MESURE DE LA BIOMASSE BACTERIENNE ET FONGIQUE

  • Etude la variation de la biomasse bactéries et champignons entre échantillon
  • Ratio cibles bactériennes/fongiques

LES POINTS FORTS D’ADNid

ADNid est le spécialiste de l’extraction d’ADN traces : ADN rares et dégradés

A partir de matrices complexes comme : sols, eaux, algues, boues, fèces, produits finis…solides ou liquides riches en polyphénols, polysaccharides, latex, acide humique.. - Spécialiste de l’extraction des ADN traces et endommagés - Utilisation de protocoles « maison » pour optimiser la récupération des populations d’ADN mineurs

Des cibles diversifiées, sur mesure

  • Cibles bactériennes : ADNr 16S
  • Cibles fongiques : ADNr 18S, ITS1 et/ou ITS2 - cibles mycorhiziennes et autres régions conservées
  • Développement de cibles sur mesure

Traitement bioinformatique des données

  • Livraison d’un table d’OTU (operational taxonomic unit)
  • Calcul de la diversité alpha et beta 
  • Courbes de raréfaction 
  • Expression graphique des résultats
  • DES RÉSULTATS ACCOMPAGNÉS POUR VOUS FACILITER LA PRISE EN MAIN DES DONNÉES

 

ADN ENVIRONNEMENTAL

ADN environnemental (ADNe) est une technique de pointe, de plus en plus utilisée au cours de ces dernières années. Elle consiste principalement en l’identification d’espèces à partir de l'ADN qu'elles laissent dans leur environnement. Cette méthode s’appuie sur des techniques de biologie moléculaire (PCR, séquençage…). Bien qu’il existe de nombreuses limites, l’ADNe est utilisé dans des domaines variés allant de la génomique à l’écologie, en passant par la paléobiologie et l’évolution.

  • Analyses de régimes alimentaires
  • Estimation de la biodiversité d'un ecosystéme
  • Détection d'espèces
  • Estimation d'abondances

Un outil pour espionner les espèces sauvages

SANTE DES PLANTES

DÉTECTION DU BYDV  FEUILLES ET GRAINES D'ORGE

Les pucerons (essentiellement Rhopalosiphum padi) présents à l’automne peuvent transmettre un virus (BYDV) responsable de la jaunisse nanisante de l’orge. 

Le virus BYDV, Barley yellow dwarf virus est un phytovirus du genre Luteovirus qui est l'un des agents responsables de la jaunisse nanisante de l'orge. Ce virus infecte principalement les cultures d'orge, mais aussi d'autres céréales, notamment le blé et l'avoine, ainsi que d'autres graminées

  • Analyse qualitative et quantitative par qPCR

DÉTECTION DU BAYOUD 

(FUSARIUM OXYSPORUM ALBEDINIS ) DANS LES SOLS ET LES RACINES DE PALMIER DATTIER

Pack screening de 8 champignons pathogènes des plantes

  • Graphiola phoenicis (Maladie : Faux charbon)
  • Thielaviopsis palmivora (Maladie : Pourriture du coeur)
  • Phytophtora palmivora (Maladie: Belât)
  • Phythium
  • Fusarium solari (Maladie : Fusariose)
  • Rhizoctonia
  • Alternaria alternata
  • Cladosporium (Maladie : cladosporiose)

 

Qui sommes-nous ?
Une agence d’information génétique responsable et engagée, attachée aux valeurs du Groupe Qualtech. Répondre aux demandes de nos clients, trouver des solutions à vos préoccupations, vous satisfaire, sont inscrits dans notre ADN. Génétiquement votre.
 
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